La SNH respecte les dispositions légales en matière de protection de l’environnement. Ses projets et ceux de ses partenaires sont au préalables soumis à des études d’impact pour toutes ses activités. Par ailleurs, elle met en œuvre un Plan National de Lutte contre les Déversements Accidentels d’Hydrocarbures via le Comité de Pilotage et de Suivi des Pipelines (CPSP).

La SNH s’implique dans des initiatives internationales pour préserver les écosystèmes, notamment grâce à un accord avec la Banque Mondiale relatif au Partenariat Mondial pour la Réduction des Gaz Torchés (GGFR). Elle est également membre de l’Association Internationale de l’Industrie Pétrolière pour la Sauvegarde de l’Environnement (IPIECA) et des Fonds Internationaux d’Indemnisation des dommages dus à la Pollution par les Hydrocarbures (FIPOL).